(1)HLA -I类分子是由轻、重两条多肽链借非共价键连接组成的异二聚体糖蛋白分子。重链即a链，是人第6号染色体HLA- I类基因编码的产物。轻链即非多态性瞰微球蛋白.是人第1 5号染色体基因编码的产物。HLA-I类分子结构可分为：

　　①抗原肽结合区：决定HLA—I类分子多态性。

　　②免疫球蛋白样区：主要包括重链α3结构域和β2微球蛋白，ɑ3结构域是CTL细胞表面cD8分子识别结合的部位;β2微球蛋白与α3结构域的结合有助于HLA-I类分子的表达和结构的稳定性。

　　③跨膜区：将HLA- I类分子锚定在细胞膜上。

　　④胞质区：可能与细胞内外信号的传递有关。

　　(2)HLAⅡ类分子是由Ⅱ类基因编码的α链和β链以非共价键结合组成的异二聚体糖蛋白分子。ɑ链和β链为跨膜蛋白，均由胞外区、跨膜区和胞内区三部分组成。HLA一Ⅱ类分子结构可分为：

　　①抗原肽结合区：决定HLA-Ⅱ类分子多态性。

　　②免疫球蛋白样区：由α2和β2结构域组成，其1g样区是Th细胞表面CD4分子识别结合的部位。

　　③跨膜区和胞质区：与HLA- I类分子相似。