实质课税原则是指应根据客观事实确定是否符合课税要件，并根据纳税人的真实负担能力决定纳税人的税负，而不能仅考虑相关外观和形式。

　　本题中，纳税人虽然通过转让定价方法减少了计税依据，但税务机关认为定价不合理重新核定计税依据，符合“根据客观事实确定是否符合课税要件，根据纳税人的真实负担能力决定纳税人税负”，因此体现了实质课税原则。

　　综上，本题应选D。

　　【提示】

　　（1）税收公平原则，即税收负担必须根据纳税人的负担能力分配，负担能力相等，税负相同；负担能力不等，税负不同；

　　（2）税收法定原则是指税法主体的权利义务必须由法律加以规定，税法的各类构成要素皆必须且只能由法律予以明确。如果没有相应法律作前提，国家则不能征税，公民也没有纳税的义务。

　　（3）税收效率原则包含经济效率和行政效率，前者要求税法的制定要有利于资源的有效配置和经济体制的有效运行，后者要求提高税收行政效率，节约税收征管成本。